Метод focus делает текущее окно активным.
окно.focus() или focus()
Пример
//Создадим новое окно win
win = window.open();
//Отобразим в новом окне произвольный текст
win.document.write("Я новое окно");
//Заставим новое окно открыться на переднем плане (установим на него фокус)
win.focus()